为推动“中国制造2025”与“互联网+”的建设，国家大力推进信息化与工业化深度融合，也是企业常说的两化融合。截至2018年10月，通过评定的企业2455家，贯标企业10045家。不少企业面临换标和年度监督审核。如何做好该体系有效运行以及迎接监督审核，是许多企业面临的挑战。
企业两化融合管理体系贯标存在的问题1.企业主动导入积极性不足尽管工信部采取了多种方式推广、培训、辅导两化融合管理体系，但在广大工业企业，准确理解该体系的不多，而且国内企业综合管理水平差别大，两化融合水平与能力差别更大，44.16%处在起步建设，49.55%单项覆盖，集成提升和创新突破6.29%，见图3。这种情况下，企业导入两化融合管理体系并良好运行，难度大。同时面对不同的管理体系，如质量、环境、职业健康等，不少企业存在着维持证书的念头，存在着“两张皮”现象，因而面对两化融合管理体系的建设，也存在着畏难和应付的状况。2.企业对体系的认识不足企业在日常运行中，习惯于以业务为导向，以惯性管理思维运行。而对体系要求的系统化、规范化，执行部门认为多余或者增加负担。而对于运行信息化技术和手段提高企业的竞争能力，企业认为没有该体系的要求，企业也会根据市场竞争的需要和企业自身的发展而采取措施，把信息化应用简单理解成一项工具（当然也会理解成管理工具），两化融合管理体系所倡导的导向与原则未真正执行,且该体系所对应建立的某种能力，多体现在过程之中，从而不被重视。3.服务机构带来的后遗症通过评定的企业大多是在咨询公司的辅导下完成的。而咨询公司水平良莠不齐，不少在服务中采用模版格式向企业灌输，企业也囫囵吞枣，满足于一堆文件及记录当中。等评定机构审核结束，证书发放下来，一切万事大吉，但企业两化融合建设仍然停留在原来的运行方式中。目前，具有两化融合管理体系评定资质的机构只有10家。在机构审核中，不同机构对于该体系的审核执行标准也不同，这是个现实问题。随着通过评定的企业越多，10家评定机构人员将面临不足，评审员继续扩张为好。